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Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  39 lines
  1. ************************************
  2. * Neuromodulin (GAP-43) signatures *
  3. ************************************
  4.  
  5. Neuromodulin (also known as GAP-43, pp46, B-50, F1, and P-57) [1] is an axonal
  6. membrane protein associated with nerve growth.  It is a major component of the
  7. motile growth cones that form the tips of elongating axons. Neuromodulin is an
  8. hydrophilic protein of 210 to 240 amino acid residues,  which binds calmodulin
  9. and  inhibits  phosphatidylinositol  phosphate  kinase  (PIP kinase).    It is
  10. phosphorylated by protein  kinase C,  and regulates the binding of GTP to G(0)
  11. [2].
  12.  
  13. Two functionally important  regions  of GAP-43 have been characterized: the N-
  14. terminal  extremity of  the protein  contains two cysteine residues  which are
  15. palmitoylated  and  are  responsible  for the attachment of the protein to the
  16. membrane; about forty residues downstream  is  a serine  residue  which can be
  17. phosphorylated  by  protein  kinase C [3]  and   which  is  adjacent  to   the
  18. calmodulin-binding domain.  We have  selected  those two regions as  signature
  19. patterns.
  20.  
  21. -Consensus pattern: <M-L-C-C-[LIVM]-R-R
  22.                     [The two C's are palmitoylated]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Consensus pattern: S-F-R-G-H-I-T-R-K-K-[LIVM]
  27.                     [S is phosphorylated]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Last update: November 1990 / First entry.
  32.  
  33. [ 1] Skene J.H.P.
  34.      Annu. Rev. Neurosci. 12:127-156(1989).
  35. [ 2] Strittmatter S.M., Valenzuela D., Kennedy T.E., Neer E.J., Fishman M.C.
  36.      Nature 344:836-841(1990).
  37. [ 3] Apel E.D., Byford M.F., Au D., Walsh K.A., Storm D.R.
  38.      Biochemistry 29:2330-2335(1990).
  39.